Diagnostican la enfermedad leptomeníngea con ADN libre de células del LCR

La enfermedad leptomeníngea se diagnostica típicamente mediante la identificación de células malignas en el líquido cefalorraquídeo (LCR), más comúnmente obtenidas mediante punción lumbar o acceso de derivación ventriculoperitoneal (VP). Análisis citológico de LCR. El método de diagnóstico más confiable actualmente tiene una sensibilidad de aproximadamente sólo el 75% y se sabe que produce resultados negativos persistentes en aproximadamente el 10% de los pacientes.

Un gran equipo de neurooncólogos del Hospital General de Massachusetts (Boston, MA, EUA) y sus colegas, llevaron a cabo un estudio de diagnóstico para evaluar el uso de la secuenciación genómica de muestras de LCR obtenidas de 30 pacientes con sospecha de o con ELM confirmada desde 2015 hasta 2018 para identificar ADNlc derivado de tumores. Este estudio consistió en dos poblaciones de pacientes: 22 pacientes con ELM confirmada citológicamente sin tumores parenquimatosos colindantes con su LCR y ocho pacientes con metástasis cerebrales parenquimatosas sin evidencia de ELM.

El ADN libre de células se aisló del plasma sanguíneo y del LCR con un instrumento QIASymphony con el kit de ADN circulante QIASymphony DSP (Qiagen, Hilden, Alemania). Se preparó un subconjunto de bibliotecas con adaptadores de identificadores moleculares únicos (Integrated DNA Technologies, Coralville, IA, EUA). Las bibliotecas preparadas se secuenciaron en instrumentos HiSeq X, HiSeq 2500 o HiSeq 4000 (Illumina, San Diego, CA, EUA) hasta una profundidad media objetivo de 0,1X. Las muestras se alinearon con hg19 utilizando bwa-mem, versión 0.7.7-r441.

Los científicos informaron que, en total, 30 pacientes (23 mujeres [77%]; mediana de edad, 51 años [rango, 28-81 años]), que se presentaban principalmente con neoplasias malignas sólidas metastásicas, participaron en este estudio. Para 48 muestras de seguimiento de pacientes diagnosticados previamente mediante análisis citológico de ELM sin tumor parenquimatoso colindante con el LCR, los hallazgos de ADNlc fueron exactos en la evaluación de la ELM en 45 muestras, mientras que el análisis citológico fue exacto en solo 36 muestras. De 43 muestras positivas para ELM, el análisis de ADNlc del LCR fue sensible para la ELM en 40 muestras y el análisis citológico fue sensible a ELM en 31 muestras, una diferencia significativa. Para tres pacientes con metástasis cerebrales parenquimatosas colindantes con el LCR y sin sospecha de ELM, los hallazgos citológicos fueron negativos para ELM en los tres pacientes, mientras que los hallazgos de ADNlc fueron positivos en los tres pacientes.

Priscilla K. Brastianos, MD, profesora asistente de medicina y coautora principal del estudio, dijo: “Si podemos diagnosticar con confianza la ELM utilizando ADN libre de células antes y con menos procedimientos invasivos, entonces podemos instituir el tratamiento antes e inscribir pacientes en ensayos clínicos para nuevos tratamientos para la ELM. La máxima esperanza es que podamos mejorar la supervivencia del paciente con un diagnóstico y tratamiento más tempranos para esta enfermedad mortal”.

Los autores concluyeron que el estudio de diagnóstico encontró una mejor sensibilidad y exactitud de las pruebas de ADNlc en el LCR, en comparación con la evaluación citológica para diagnosticar la ELM, con la excepción de los tumores parenquimatosos colindantes con el LCR, lo que sugiere una mejor capacidad para diagnosticar la ELM. El estudio fue publicado el 9 de agosto de 2021 en la revista JAMA Network Open.

Enlace relacionado:
Hospital General de Massachusetts
Integrated DNA Technologies
Illumina