Nueva prueba rápida de hantavirus allana el camino para control temprano de brotes

Un equipo de investigación de la Facultad de Medicina de la Universidad de Corea (Seúl, Corea del Sur) llevó a cabo un estudio en la provincia de Gyeonggi para investigar la prevalencia, la carga viral y las variaciones genéticas del ortohantavirus Hantaan (FHSR). Utilizaron la secuenciación Flongle, un enfoque innovador y económico, para detectar genomas de FHSR, enfatizando el uso del secuenciador de nanoporos Oxford MinION en el campo de las tecnologías de secuenciación de próxima generación. La metodología del equipo incluyó la captura de roedores y musarañas de diversas áreas utilizando trampas vivas, seguida de análisis de ADN mitocondrial, pruebas de anticuerpos por inmunofluorescencia indirecta y otros métodos moleculares para la identificación de especies y la detección de virus.

Durante la vigilancia de 2017-2018 en la provincia de Gyeonggi, se observó una presencia sustancial de Apodemus agrarius, una especie de roedor común. Entre ellos, el 12,4 % resultó ser seropositivo al FHSR, lo que indica la prevalencia del virus en la región. El uso de la secuenciación Flongle fue clave para adquirir secuencias genómicas completas a partir de muestras positivas, logrando altas tasas de cobertura y precisión a la par con la secuenciación de Illumina. El análisis filogeográfico del estudio reveló una divergencia evolutiva distinta entre los genomas tripartitos del FHSR, con agrupaciones genéticas e incongruencias en los patrones evolutivos que resaltan la evolución específica del segmento del virus.

Si bien el estudio ofrece información crítica, los investigadores reconocen limitaciones como la necesidad de pruebas de sensibilidad mejoradas de los diagnósticos basados en Flongle y el requisito de datos genómicos y epidemiológicos más amplios en ciertas áreas endémicas. Esta investigación representa un avance importante en la comprensión de los ortohantavirus y sienta las bases para estrategias más específicas para combatir los brotes de FHSR. Los hallazgos subrayan la importancia de la genómica en la vigilancia de enfermedades y son prometedores para mejorar las respuestas a las enfermedades infecciosas emergentes.

“Desarrollamos un diagnóstico in situ rápido y sensible utilizando un chip Flongle basado en nanoporos con un coste razonable de alrededor de 100 dólares. Este métod permite secuenciar prácticamente el genoma completo del FHSR en tres horas”, afirmó el profesor Jin-Won Song de la Facultad de Medicina de la Universidad de Corea, quien dirigió la investigación. "Creemos que nuestros hallazgos proporcionan información importante sobre el diagnóstico in situ, la vigilancia basada en el genoma y la dinámica evolutiva de los ortohantavirus para mitigar los brotes de hantavirus en áreas endémicas de FHSR en la República de Corea. Nuestro estudio es pionero en la integración de la rentable secuenciación Flongle en el diagnóstico de hantavirus, que ofrece una herramienta rápida y precisa para la detección in situ. Esta innovación tiene el potencial de transformar la forma en que abordamos y gestionamos los brotes de hantavirus".

Enlaces relacionados:
Facultad de Medicina de la Universidad de Corea