Nuevo enfoque de biopsia líquida promete detectar recurrencia del cáncer de mama

Muchas estrategias de biopsia líquida para monitorizar la recurrencia del cáncer de mama se centran en detectar mutaciones genéticas en el ADN tumoral. Los investigadores están evaluando si rasgos adicionales del ADN libre de células circulante (ADNlc) pueden reflejar mejor la biología tumoral vinculada a la resistencia al tratamiento y a la recaída.

En la Universidad de Kumamoto, los investigadores analizaron patrones de nucleosomas y firmas del tamaño de los fragmentos en el ADNlc de pacientes con enfermedad primaria y recurrente. Los nuevos hallazgos demuestran que un enfoque centrado en los nucleosomas puede diferenciar el cáncer de mama recurrente del primario en una cohorte retrospectiva.

Los investigadores de la Universidad de Kumamoto desarrollaron una estrategia de perfilado de nucleosomas “informada por la transcripción” que examina cómo se empaqueta el ADN en torno a las proteínas histonas dentro de los nucleosomas. Dado que la posición de los nucleosomas refleja la regulación génica y la accesibilidad de la cromatina, los patrones en el ADNlc derivado de la sangre pueden captar cambios reguladores que ocurren dentro de las células cancerosas y no solo mutaciones en la secuencia.

El equipo se centró en 26 regiones genómicas previamente asociadas con cambios transcripcionales que surgen a medida que las células del cáncer de mama desarrollan resistencia a la terapia hormonal, con el razonamiento de que estos loci podrían aportar información sobre la biología de la recurrencia.

El estudio analizó ADNcf de 150 muestras de cáncer de mama, incluidas 105 de tumores primarios y 45 de enfermedad recurrente o metastásica. En comparación con las muestras primarias, la enfermedad recurrente mostró un mayor número de variantes genéticas y fragmentos de ADNlc más cortos.

Dos regiones genómicas, RERE y SYNPO2, fueron especialmente discriminativas, y una puntuación basada en nucleosomas derivada de estos loci distinguió la enfermedad primaria de la recurrente con un área bajo la curva (AUC) de 0.826. La combinación de métricas de nucleosomas con otras características del ADNlc mediante aprendizaje automático mejoró aún más la predicción de la recurrencia dentro del conjunto de datos.

Los autores señalan que el ADNlc puede aportar información más allá de una simple instantánea de las mutaciones al reflejar cambios en la regulación génica y en la cromatina asociados con la resistencia terapéutica y la recaída. Como el ADNlc se obtiene a partir de una muestra de sangre, este enfoque podría contribuir a la monitorización mínimamente invasiva durante el tratamiento y después de él, lo que potencialmente permitiría una detección más temprana de la recurrencia y decisiones más personalizadas.

El carácter retrospectivo del análisis y las diferencias en los subtipos de cáncer de mama y en los antecedentes de los pacientes subrayan la necesidad de estudios prospectivos más amplios para aclarar su generalizabilidad. La investigación, en la que participaron el Instituto de Embriología Molecular y Genética (IMEG) y el Hospital Universitario de Kumamoto, se publicó en Cancer Research Communications el 15 de junio de 2026.

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